PAINEL SOMÁTICO PARA, GENES DA VIA DE REPARO HOMÓLOGA DO DNA, Bloco de Parafina

Orientações do cliente

I - Informações sobre o exame:

• Este exame consiste no sequenciamento completo de 22 genes a partir de amostras de tumor emblocadas em parafina, seguida de análise das variantes genômicas e interpretação dos dados clínicos e moleculares realizada por equipe especializada. O exame pode ser realizado em material obtido a partir de tecidos (blocos de parafina ou lâminas histológicas), sendo útil na investigação de doença metastática ou localmente avançada ao diagnóstico, doença refratária às opções padronizadas de tratamento, amostra onde uma avaliação gradual não é possível devido à escassez de material.

II - Critérios de realização:

• Para a realização deste exame é necessária solicitação médica.
• É imprescindível que seja fornecida cópia do laudo anatomopatológico original da análise do material.
• Poderão ser aceitos os seguintes materiais:
• Fragmentos de tecido fixados em formalina 10% tamponada, embebidos ou não em parafina (enviar em temperatura ambiente);
• Lâminas de corte histológico (enviar em temperatura ambiente)
• Caso sejam enviadas somente lâminas para a análise, são necessárias no mínimo 16 (dezesseis) lâminas em branco (não coradas), não montadas; seção de 5µm de espessura, em porta-lâminas.

ATENÇÃO: Não serão aceitas lâminas com resina ou material fora das condições citadas acima.

• O tecido deve ter sido fixado previamente em formalina tamponada o mais rápido possível após a biópsia ou cirurgia. A fixação deve ser de, no mínimo, seis horas e, no máximo, 72 horas. A adoção de cuidados na coleta e na fixação da amostra garantem o sucesso do teste.
• Caso seja enviado fragmento de tecido sem análise prévia (biópsia), o material deverá ser submetido a exame anatomopatológico (abrir item ANATPATP ou ANATPATPTE) para confirmação do diagnóstico naquela amostra.
• É necessário que a amostra tenha células tumorais não necróticas presentes em quantidade superior a 20%.
• É importante salientar que o material enviado sempre será analisado por um médico patologista antes da realização do exame. Dessa forma, se o material enviado for insuficiente ou inadequado para o teste, o mesmo não poderá ser realizado.

Orientações necessárias

I - Informações sobre o exame:

• Este exame consiste no sequenciamento completo de 22 genes a partir de amostras de tumor emblocadas em parafina, seguida de análise das variantes genômicas e interpretação dos dados clínicos e moleculares realizada por equipe especializada. O exame pode ser realizado em material obtido a partir de tecidos (blocos de parafina ou lâminas histológicas), sendo indicado na investigação de doença metastática ou localmente avançada ao diagnóstico, doença refratária às opções padronizadas de tratamento, amostra onde uma avaliação gradual não é possível devido à escassez de material.

II - Critérios de realização:

• Para a realização deste exame é necessária solicitação médica.
• É imprescindível que seja fornecida cópia do laudo anatomopatológico original da análise do material.
• Poderão ser aceitos os seguintes materiais:
• Fragmentos de tecido fixados em formalina 10% tamponada, embebidos ou não em parafina (enviar em temperatura ambiente);
• Lâminas de corte histológico (enviar em temperatura ambiente)
• Caso sejam enviadas somente lâminas para a análise, são necessárias no mínimo 16 (dezesseis) lâminas em branco (não coradas), não montadas; seção de 5µm de espessura, em porta-lâminas.

ATENÇÃO: Não serão aceitas lâminas com resina ou material fora das condições citadas acima.

• O tecido deve ter sido fixado previamente em formalina tamponada o mais rápido possível após a biópsia ou cirurgia. A fixação deve ser de, no mínimo, seis horas e, no máximo, 72 horas. A adoção de cuidados na coleta e na fixação da amostra garantem o sucesso do teste.
• Caso seja enviado fragmento de tecido sem análise prévia (biópsia), o material deverá ser submetido a exame anatomopatológico (abrir item ANATPATP ou ANATPATPTE) para confirmação do diagnóstico naquela amostra.
• É necessário que a amostra tenha células tumorais não necróticas presentes em quantidade superior a 20%.
• É importante salientar que o material enviado sempre será analisado por um médico patologista antes da realização do exame. Dessa forma, se o material enviado for insuficiente ou inadequado para o teste, o mesmo não poderá ser realizado.

Para saber sobre estes exames e como realizar, acesse:

https://www.fleurygenomica.com.br/

Processamento e adequação da amostra

Enviar o material (lâminas, material fresco ou blocos de parafina) à Seção de Anatomia patológica junto com cópia do laudo anatomopatológico original (quando o material não tiver sido analisado no Fleury) em temperatura ambiente.

Método

As amostras tumorais fixadas serão avaliadas por médico patologista que fará a seleção da área tumoral representativa. Dez seções de cada tumor serão utilizadas para a extração do DNA. O protocolo segue um preparo inicial para a fragmentação das moléculas de DNA e inserção de adaptadores com indexes únicos. Em seguida, é realizada a etapa de enriquecimento das regiões de interesse por captura híbrida. A captura de toda a região codificante de 22 genes é realizada por meio de um painel customizado e, em seguida, sequenciada simultaneamente no equipamento NextSeq500 (Illumina). Os dados do sequenciamento são processados em um pipeline de bioinformática desenvolvido e validado internamente. As variantes são identificadas e filtradas nesse pipeline. Os resultados de cada caso são discutidos individualmente por uma equipe multidisciplinar composta por médicos patologistas moleculares, geneticistas e equipe técnico-científica para a confecção do laudo.

Valor de referência

• O resultado será acompanhado de um relatório interpretativo

Interpretação e comentários

O teste avalia simultaneamente 22 genes da via de reparo homóloga do DNA, por meio do sequenciamento de nova geração. A avaliação de mutações no tecido tumoral permite a identificação de variantes preditivas de sensibilidade ou resistência a terapias-alvo, bem como direcionadoras do prognóstico. São avaliadas as seguintes alterações:

• alterações de nucleotídeo único (SNVs),
• pequenas inserções e deleções (INDELS)
• grandes amplificações e perdas gênicas (CNVs)

Os resultados são acompanhados por um laudo interpretativo.

Lista dos 22 genes avaliados:

ATM BARD1 BRCA1 BRCA2 BRIP1 CDK12 CHEK1 CHEK2 ERCC3 FANCA FANCL HDAC2 MLH3 MRE11 NBN PALB2 PPP2R2A RAD51 RAD51B RAD51C RAD51D RAD54L