SEQUENCIAMENTO DO GENOMA COMPLETO DE SARS-COV-2, NGS, raspado respiratório

Orientações do cliente

"I - Informação sobre o exame

• Este exame realiza o sequenciamento do genoma completo do vírus SARS-CoV-2, agente da Covid-19, e é capaz de identificar todas as variantes de preocupação em circulação atualmente.

II - Critérios de realização

NECESSÁRIO AGENDAMENTO PRÉVIO.

• É necessário apresentar documento de identificação com foto.
• Clientes menores de 16 anos de idade devem estar acompanhados de um responsável legal para realização do exame.
• É necessário que o cliente tenha recebido diagnóstico prévio de infecção por SARS-CoV-2 confirmada laboratorialmente por teste direto (molecular ou de antígeno) nos últimos 15 dias.
• Serão aceitas somente amostras de raspado (swab) de nasofaringe combinado ao raspado de orofaringe, com resultado prévio positivo (SARS-CoV-2 detectado).
• O resultado deste teste é complementar e não substitui o de detecção de SARS-CoV-2 por RT-PCR em tempo real, padrão-ouro para o diagnóstico de Covid-19 na fase aguda da doença.
• Clientes que tenham realizado o exame de RT-PCR no Grupo Fleury e apresentado resultado positivo poderão realizar o exame sem a necessidade de uma nova coleta, utilizando o material coletado anteriormente, desde que a coleta tenha ocorrido nos últimos 15 dias. Neste caso, é necessário entrar em contato com a Central de Atendimento ao Cliente para mais informações.

ATENÇÃO: Este método só pode ser aplicado a amostras com uma carga viral relativamente alta. Por isso, antes do sequenciamento propriamente dito, é realizada uma análise por RT-PCR para verificar se a carga viral é suficiente. Se a carga viral for considerada baixa, o teste de sequenciamento não poderá ser realizado – mesmo em amostras já armazenadas no laboratório, pois há risco de decaimento da carga viral. Caso o sequenciamento não seja possível devido à insuficiência da carga viral, será efetuada a devolução parcial do valor pago pelo exame. A quantia retida corresponde aos custos do teste de RT-PCR, etapa prévia e indispensável para o sequenciamento completo do gene."

Orientações necessárias

"I - Informação sobre o exame

• Este exame realiza o sequenciamento do genoma completo do vírus SARS-CoV-2, agente da Covid-19, e é capaz de identificar todas as variantes de preocupação em circulação atualmente.

II - Critérios de realização

NECESSÁRIO AGENDAMENTO PRÉVIO.

• É necessário apresentar documento de identificação com foto.
• Clientes menores de 16 anos de idade devem estar acompanhados de um responsável legal para realização do exame.
• É necessário que o cliente tenha recebido diagnóstico prévio de infecção por SARS-CoV-2 confirmada laboratorialmente por teste direto (molecular ou de antígeno) nos últimos 15 dias.
• Serão aceitas somente amostras de raspado (swab) de nasofaringe combinado ao raspado de orofaringe, com resultado prévio positivo (SARS-CoV-2 detectado).
• O resultado deste teste é complementar e não substitui o de detecção de SARS-CoV-2 por RT-PCR em tempo real, padrão-ouro para o diagnóstico de Covid-19 na fase aguda da doença.
• Clientes que tenham realizado o exame de RT-PCR no Grupo Fleury e apresentado resultado positivo poderão realizar o exame sem a necessidade de uma nova coleta, utilizando o material coletado anteriormente, desde que a coleta tenha ocorrido nos últimos 15 dias. Neste caso, é necessário entrar em contato com a Central de Atendimento ao Cliente para mais informações.

ATENÇÃO: Este método só pode ser aplicado a amostras com uma carga viral relativamente alta. Por isso, antes do sequenciamento propriamente dito, é realizada uma análise por RT-PCR para verificar se a carga viral é suficiente. Se a carga viral for considerada baixa, o teste de sequenciamento não poderá ser realizado – mesmo em amostras já armazenadas no laboratório, pois há risco de decaimento da carga viral. Caso o sequenciamento não seja possível devido à insuficiência da carga viral, será efetuada a devolução parcial do valor pago pelo exame. A quantia retida corresponde aos custos do teste de RT-PCR, etapa prévia e indispensável para o sequenciamento completo do gene."

Processamento e adequação da amostra

"O material preferencial para este exame é o raspado de nasofaringe combinado ao raspado de orofaringe (raspado de material do trato respiratório).

• Enviar material refrigerado primeiramente parao setor BMO em até 24 horas após a coleta, e protocolar a etiqueta da seção ACGenomica. Para materiais coletados em tempo superior a 24h, congelar. Materiais congelados por tempo superior a 72 horas só poderão ser aceitos se tiverem permanecido a, pelo menos, -70°C por todo o período de armazenamento e durante o transporte.
• As amostras de cada cliente devem ser acondicionadas, cada qual, em um saco plástico.
• Em hipótese alguma amostras de diferentes clientes podem ser acondicionadas em um mesmo saco plástico, uma vez que isso aumenta o risco de contaminação, caso haja um vazamento.
• Não serão aceitos frascos vazados ou em temperatura ambiente.

Método

Sequenciamento de nova geração (NGS) do genoma completo do vírus SARS-CoV-2.

Interpretação e comentários

"Este teste realiza a análise do genoma completo do vírus SARS-CoV-2 por meio de sequenciamento de nova geração (NGS), com o objetivo de identificar todas as variantes de preocupação atualmente em circulação.

Para que o teste possa ser realizado com sucesso, é essencial que a amostra apresente uma carga viral com valor de Ct (cycle threshold) igual ou inferior a 30."